Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHIPQ96QV1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHIPQ96QV1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHIPQ96QV1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHIPQ96QV1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms