Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP4Q96PP9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms