Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMTM3Q96MX0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms