Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC43Q96MW1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC43Q96MW1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms