Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC7Q96M83 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC7Q96M83 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms