Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms