Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SAMD8Q96LT4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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