Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJD4Q96KN9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms