Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EAF1Q96JC9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms