Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIC2Q96JB3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIC2Q96JB3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms