Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC34Q96HJ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms