Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms