Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMTM5Q96DZ9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMTM5Q96DZ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms