Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms