Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFT1Q96AA3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms