Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHF3Q92576 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF3Q92576 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms