Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPDL3AQ92484 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms