Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113Q902F9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms