Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX54Q8TDD1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms