Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC191Q8NCU4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC191Q8NCU4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC191Q8NCU4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms