Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX3Q8N9I9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms