Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CHCHD4Q8N4Q1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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CHCHD4Q8N4Q1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHCHD4Q8N4Q1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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