Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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LRRC18Q8N456 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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LRRC18Q8N456 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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LRRC18Q8N456 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRC18Q8N456 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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