Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPC2Q8N158 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC2Q8N158 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms