Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPAP2Q8IXW5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms