Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC50Q8IVM0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms