Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX29P2Q8IUI4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms