Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNL1Q8IU54 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms