Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC84Q86UT8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms