Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT27Q7Z3Y8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT27Q7Z3Y8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms