Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREML4Q6UXN2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREML4Q6UXN2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms