Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms