Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUX4L9Q6RFH8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUX4L9Q6RFH8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUX4L9Q6RFH8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUX4L9Q6RFH8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUX4L9Q6RFH8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUX4L9Q6RFH8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms