Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L2Q6R6M4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms