Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF544Q6NX49 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms