Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATG16L1Q676U5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms