Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRCH2Q5VUJ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms