Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC183Q5T5S1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC183Q5T5S1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms