Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C10orf55Q5SWW7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms