Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms