Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ANKRD39Q53RE8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ANKRD39Q53RE8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms