Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL38Q2WGJ6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL38Q2WGJ6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms