Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL8BQ17RB0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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