Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRNQ16849 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTPRNQ16849 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTPRNQ16849 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTPRNQ16849 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTPRNQ16849 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRNQ16849 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRNQ16849 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRNQ16849 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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