Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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