Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA2Q15822 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
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