Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPTX1Q15818 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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