Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CEBPEQ15744 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CEBPEQ15744 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms