Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SF1Q15637 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SF1Q15637 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SF1Q15637 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SF1Q15637 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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