Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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